偏头痛和丛集性头痛的诊断主要基于仔细的临床病史。双侧下丘脑和大脑皮层周围（PAG）功能网络是将偏头痛和丛集性头痛患者与对照组进行分类的最重要的MRI特征。左侧丘脑网络是对偏头痛和丛集性头痛患者进行分类的最具辨别力的MRI特征。由此可见，功能性生物标志物，包括下丘脑和PAG网络，是偏头痛和丛集性头痛患者共有的。丘脑皮层通路可能是区分偏头痛和丛集性头痛发作的神经基础。
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