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北京协和医院神经内科成立于1921年求医网报道，历经90多年的风风雨雨，已成为全国知名的神经内科。 在疑难杂症、重症疾病的治疗和解决方面处于国内领先地位。 现设有11个专业组（临床神经生理学、脑电图与癫痫、痴呆与认知障碍、脑血管病、帕金森与运动障碍、神经病理学、神经肌肉疾病、感染与脑脊液细胞学、神经免疫学、神经遗传学与睡眠），开设9个专科门诊（神经肌肉疾病门诊、肌张力障碍及肉毒毒素治疗门诊、帕金森病及阿尔茨海默病门诊、癫痫门诊、脑血管疾病门诊、运动神经元疾病、重症肌无力门诊、多发性硬化症门诊、头痛门诊等），提供高水平的医疗服务给大量患者。 连续6年在复旦大学神经内科专业声誉榜中位居第一。
本系专业齐全神经科头痛，技术力量雄厚。 临床基本功扎实，综合实力雄厚，尤其在疑难杂症、重症疾病的治疗和解决方面处于国内领先地位，吸引了来自全国各地的大批疑难杂症患者。 科室现有床位90余张，每年接待门急诊患者16万余人次，住院患者1600余人次。 神经内科实验室设备齐全，肌电及脑诱发电位、神经病理、脑电图、经颅超声多普勒、神经生化与免疫、分子生物学实验室国内领先，为患者诊疗提供优质服务。 辅助实验室检查水平。
重点开展面向临床的科学研究，旨在探索创新诊疗方法，提高临床诊疗水平。 研究内容涵盖神经系统疾病主要领域，临床与基础研究相辅相成，促进学科水平的提高。 近五年来，承担科研项目40余项，其中国家级科研项目20项，科研经费总额超过3000万元。 近五年获得国家科技进步二等奖、中华医学科技进步二等奖以及多项省部级科研成果奖。
该系承担着大量的教学任务。 承担北京协和医学院八年制医科大学本科生、研究生、高级医师的教学工作。 是北京市住院医师规范化培训基地。 每年举办5期国家继续教育班，其中包括神经系统疾病进阶班； 经颅多普勒超声课程； 肌电图和脑诱发电位课程； 脑电图及癫痫诊治进展班； 肌张力障碍的诊断和治疗等，为全国输送了大批神经内科专科人才。
全系现有博士57人，其中教授11人，副教授17人，主治博士18人，住院医师11人，其中博士生导师7人，硕士生导师8人。 各级护理人员50人。 部门高度重视人才培养。 老一辈知名专家日益壮大，中青年专家年轻有为，年轻医生迅速成长。 90%的高级教师具有出国留学和进修的经历。 现任科室主任崔立英教授，现任中华医学会神经病学分会（第七届）主任委员、《中华神经病学杂志》主编。 还担任中华医学会神经病学分会第四届主任委员。 10余人担任国内多家核心期刊副主编、编委。
