设有儿科、妇科、产科、中医科4个省级重点学术（专科）科室； 5个省级医疗质控中心：新生儿医疗质控中心、儿科危重症医疗质控中心、小儿呼吸内镜医疗质控中心、儿童胃肠内镜医疗质控中心、儿童血液净化医疗质控中心； 9个市级重点（专科）科室：新生儿科、小儿外科、妇幼保健科、儿童消化内科、儿童呼吸内科、小儿肾风湿免疫科、儿童康复科、辅助生殖技术科、乳腺外科； 7个市级医疗质控中心：儿科质控中心、儿科质控中心新生儿组、妇科质控中心、产科质控中心、医疗美容质控中心、超声影像质控中心、耳鼻喉科质控中心。 同时，贵阳市妇幼保健院是国家级儿童早期发展示范基地、国家级妇产儿住院医师规范化培训基地、国家级新生儿科医师规范化培训基地、国家级妇产科住院医师规范化培训基地。国家级小儿呼吸内镜培训基地，国家级小儿呼吸内镜培训基地。 母婴人才培养基地。 这些培训基地促进了全省妇产儿医疗卫生人才培养和妇幼保健事业高质量发展。 是北京儿童医院、复旦大学附属儿科医院、重庆医科大学附属儿童医院、北京妇产医院、广东省妇幼保健院等国内知名妇幼医院的技术合作单位。是复唐儿童医学发展研究中心（北京儿童医院）成员单位。 医院集团）和西部儿科发展联盟副理事长单位。
2015年，以贵阳市妇幼保健院为牵头单位成立了贵州省妇幼保健专科联盟。 目前会员单位已发展到35家，覆盖全省所有市（州）、县； 同时，各专业学科还牵头成立了贵州省儿童医学专业联盟、贵州省儿科重症医学专业联盟、贵州省儿童保健专业联盟、贵州省妇幼乳腺专业联盟、贵州省流产后护理专业联盟等。联盟等在全省设有联盟单位，助推全省分级诊疗、妇幼保健人才培养和妇幼保健服务能力提升。
